Científicos de la UA logran secuenciar el genoma del SARS-CoV-2
Hallazgo constituye un hito para la casa de estudios. Las muestras analizadas correspondían a pacientes de Mejillones y Antofagasta, en las cuales se detectó la presencia de variantes del virus que causa la enfermedad de Covid-19.
Científicos de la Universidad de Antofagasta (UA) lograron secuenciar el genoma (mapa genético) de cinco muestras del virus Síndrome Respiratorio Agudo Severo, conocido por sus siglas en inglés SARS-CoV-2 y causante de la enfermedad Covid-19.
Esta es la primera vez que desde la casa de estudios se logra realizar la secuenciación del coronavirus, lo que se llevó a cabo gracias al trabajo efectuado por el equipo de la Facultad de Ciencias de la Salud .
Estos genomas fueron aislados de muestras obtenidas entre febrero y abril pasado por el Centro Oncológico Norte (CON) y provenientes de pacientes Covid-19 de Antofagasta y Mejillones. La secuenciación se realizó utilizando la Tecnología de Nanoporo (SGTN) y permitió detectar que las personas estaban infectadas con las variantes Gama (P1, originada en Brasil), Épsilon (B.1.429, de California) y el linaje B.1.1.348.
"La secuenciación genómica del virus es muy importante, pues nos permite ver la trayectoria, evolución y frecuencia de variantes en la región y el país, contribuyendo al conocimiento sobre cambios biológicos, transmisibilidad, virulencia, evasión de la inmunidad, eficacia de las vacunas y estrategias de diagnóstico, entre otros aspectos",explica la doctora Alexandra Galetovic del Departamento Biomédico de la UA, quien encabeza el equipo de científicos.
La práctica de la vigilancia genómica permite estudiar las mutaciones que experimentan los virus, como es en este caso el SARS-CoV-2, tal como lo efectúa el Instituto de Salud Pública (ISP) con muestras obtenidas de viajeros.
Es por eso que el doctor Jorge Araya del Departamento de Tecnología Médica de esta misma universidad explica queconociendo las características etiopatológicas, la secuenciación del virus permite relacionarlo con las mutaciones que lo vuelven más peligroso y saber qué tipo de enfermedades podría ocasionar.
"La información que aportamos es fundamental, pues junto a la que entregan otros centros de investigación, sirve para que el ISP y el Minsal tomen medidas preventivas, pues este virus seguirá presente por más tiempo. Nuestro laboratorio aún es pequeño, pero es tremendamente significativo este logro que alcanzamos junto a todo el equipo", afirma Araya.
En tanto, el doctor Marcos Cikutovi, decano de la Facultad de las Ciencias de la Salud, detalla el aporte científico de esta secuenciación.
"Esto significa que estamos aportando a la trazabilidad mundial del virus, pues está información queda a disposición de los centros científicos de salud de todo el planeta. Un aspecto preocupante si de este trabajo, es que demuestra la altísima movilidad de las nuevas variantes, pues encontramos algunas que fueron descritas en California y en Brasil", indica.
El Laboratorio de Genómica Microbiana (LGM) de la Facultad de Ciencias de la Salud de la Universidad de Antofagasta, forma parte del Plan de Aceleración, impulsado por el Ministerio de Ciencias para secuenciar en diferentes regiones del país, el SARS CoV-2 y detectar variantes del virus.
Con la Vigilancia Genómica a nivel regional, las universidades contribuyen con datos al ISP y al Minsal, para mantener la información actualizada de las variantes que circulan en el país y tomar medidas de aislamiento, seguimiento y trazabilidad.
Se debe destacar que este equipo de trabajo también está integrado por el Dr. Benito Gómez, la magíster Camila Salazar y los estudiantes de pregrado Alexander Pérez, Gabriel Peña, Martín Vargas y de postgrado Yubitza Estay de la Universidad de Antofagasta.
"Agradecemos de forma muy especial por el apoyo recibido para esta investigación al Centro Oncológico del Norte, al Consorcio de Genomas CoV-2 (www.cov2.cl), así como al trabajo colaborativo de las universidades de Chile, de Magallanes y Católica de Chile"añade la doctora Alexandra Galetovic.
"La secuenciación del virus es muy importante, pues nos permite ver la trayectoria, evolución y frecuencia de variantes en la región"
Doctora Alejandra Galetivic.